2008年湘雅三医院规模建设基本完成，院党委和行政清醒地认识到，医院在当前发展进程中面临着三个重大的困难和问题：第一、与高水平的部属部管医院比较，医院的整体学科实力仍十分薄弱，全国知名的学术带头人仍十分缺乏，一部分高水准的临床技术项目仍没有在我院开展。不解决这个问题，可持续发展就会缺乏后劲；第二、医院近三年医疗服务量的成倍增长，危重病人比例的迅速上升与我院医疗服务系统和医疗管理系统的承载能力之间的矛盾日益突出。不解决这个问题，医疗系统的运转风险势必越来越大；第三、巨额负债使医院抵御经济风险、自主发展的能力受到严重限制。必须通过大幅度增加业务量、提高系统运转效益来改变这个局面。这三大问题中任何一个问题恶化都是致命性的；而任何一个问题的改善都将大大促进我院的健康快速发展。

针对医院当前发展的大好形势和发展进程中面临的这三大问题，医院党政领导决定，以此次学习实践科学发展观活动为契机，在认真学习、领会新医改方案的精神实质，确定今年为医院的“内涵建设年”，其总体思路是：以科学发展观统领全局，积极配合新一轮医疗卫生体制改革，继续实践“三个坚持、三个建设”的办院理念，以学科建设为核心，大力强化医疗质量和医疗安全管理，大力强化人员培训、大力改善后勤服务质量，全面提高医院内涵建设水平，推动医院又好又快发展。